MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 6568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009051	ACA	2	6	1509952	1509957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_009051	TA	3	6	1513310	1513315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_009051	AT	3	6	1515107	1515112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_009051	TAT	3	9	1515110	1515118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_009051	AT	3	6	1515129	1515134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_009051	A	7	7	1515143	1515149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_009051	CGG	2	6	1515178	1515183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_009051	CGCA	2	8	1515220	1515227	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4009	NC_009051	CAG	2	6	1515387	1515392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_009051	GTG	2	6	1515457	1515462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_009051	GCGGA	2	10	1515489	1515498	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4012	NC_009051	GAA	2	6	1515508	1515513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_009051	AAC	2	6	1515561	1515566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_009051	GCG	2	6	1515589	1515594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_009051	T	7	7	1515626	1515632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_009051	GCA	2	6	1519031	1519036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_009051	GTT	2	6	1519064	1519069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_009051	GCC	2	6	1520161	1520166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_009051	CTC	2	6	1520182	1520187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_009051	GGC	2	6	1520261	1520266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_009051	AAT	2	6	1520290	1520295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_009051	A	7	7	1520303	1520309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_009051	ATC	2	6	1520320	1520325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_009051	A	6	6	1521648	1521653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_009051	T	6	6	1521662	1521667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_009051	AT	3	6	1521731	1521736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_009051	TAA	2	6	1521746	1521751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_009051	CG	3	6	1524472	1524477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4029	NC_009051	TC	3	6	1524907	1524912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4030	NC_009051	A	6	6	1524986	1524991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_009051	TA	4	8	1526950	1526957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_009051	GA	3	6	1526983	1526988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_009051	AGG	2	6	1528564	1528569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_009051	CCGG	2	8	1528573	1528580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_009051	CCCGCG	2	12	1528596	1528607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4036	NC_009051	AGA	2	6	1528661	1528666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_009051	TC	3	6	1528772	1528777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4038	NC_009051	ATT	2	6	1528795	1528800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_009051	GACG	2	8	1528840	1528847	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4040	NC_009051	GGCA	2	8	1528856	1528863	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4041	NC_009051	TA	3	6	1528870	1528875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_009051	ATG	2	6	1528882	1528887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_009051	TAA	2	6	1531579	1531584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_009051	TCA	2	6	1531660	1531665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_009051	CGCC	2	8	1531729	1531736	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4046	NC_009051	A	7	7	1532277	1532283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_009051	AGG	2	6	1533700	1533705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_009051	GA	3	6	1533718	1533723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_009051	CAAC	2	8	1533775	1533782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4050	NC_009051	TGTT	2	8	1538095	1538102	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_009051	A	8	8	1538120	1538127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_009051	TA	3	6	1538132	1538137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_009051	CGCAC	2	10	1538196	1538205	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4054	NC_009051	CGG	3	9	1538220	1538228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_009051	GCA	2	6	1538242	1538247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_009051	CGG	2	6	1538278	1538283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_009051	CAT	2	6	1538296	1538301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_009051	ACCA	2	8	1538314	1538321	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4059	NC_009051	TC	3	6	1539030	1539035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4060	NC_009051	CTA	2	6	1539052	1539057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_009051	AGG	2	6	1539142	1539147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_009051	GTGA	2	8	1539152	1539159	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_009051	AAT	2	6	1539220	1539225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_009051	GTG	2	6	1539244	1539249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_009051	TA	3	6	1539301	1539306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_009051	A	7	7	1542365	1542371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_009051	C	6	6	1542401	1542406	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4068	NC_009051	CCA	2	6	1542437	1542442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4069	NC_009051	TAT	2	6	1543444	1543449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4071	NC_009051	TGA	2	6	1543534	1543539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_009051	G	6	6	1543620	1543625	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_009051	G	6	6	1543681	1543686	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_009051	C	6	6	1543691	1543696	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4077	NC_009051	TAT	2	6	1546113	1546118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_009051	A	7	7	1546131	1546137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_009051	GGA	2	6	1546175	1546180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_009051	GTTC	2	8	1546233	1546240	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4081	NC_009051	GAGG	2	8	1546257	1546264	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_009051	ACCGG	2	10	1546270	1546279	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4083	NC_009051	GCG	2	6	1546280	1546285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4085	NC_009051	TTC	2	6	1546356	1546361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_009051	CATT	2	8	1546382	1546389	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4087	NC_009051	TTGA	2	8	1546470	1546477	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_009051	AGG	3	9	1546482	1546490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_009051	TGT	2	6	1547083	1547088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_009051	CGT	2	6	1547090	1547095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4092	NC_009051	A	6	6	1547202	1547207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_009051	A	6	6	1547214	1547219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_009051	CAT	2	6	1547245	1547250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4096	NC_009051	A	6	6	1552685	1552690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_009051	TCG	2	6	1552722	1552727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_009051	CGGG	2	8	1552733	1552740	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4099	NC_009051	AAG	2	6	1553979	1553984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_009051	TGTCG	2	10	1554016	1554025	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4101	NC_009051	TCGG	2	8	1554027	1554034	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4102	NC_009051	GAG	2	6	1554037	1554042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_009051	GCC	2	6	1554072	1554077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4104	NC_009051	AC	4	8	1554838	1554845	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4105	NC_009051	AGG	2	6	1554856	1554861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_009051	GAG	2	6	1554867	1554872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_009051	GCC	2	6	1554887	1554892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4108	NC_009051	AAGA	2	8	1554909	1554916	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_009051	CGT	2	6	1557989	1557994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_009051	TCC	2	6	1561495	1561500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4111	NC_009051	GCGA	2	8	1561527	1561534	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4112	NC_009051	CGG	2	6	1561550	1561555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_009051	GCG	2	6	1561564	1561569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_009051	GCC	2	6	1561570	1561575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4115	NC_009051	CGA	2	6	1561603	1561608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_009051	TAT	2	6	1561609	1561614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_009051	A	6	6	1562397	1562402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_009051	TTG	2	6	1562431	1562436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_009051	GT	3	6	1563865	1563870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_009051	ACG	2	6	1563943	1563948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_009051	GAA	2	6	1563953	1563958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_009051	CAGGA	2	10	1563969	1563978	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4123	NC_009051	GAG	2	6	1564002	1564007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_009051	G	6	6	1564050	1564055	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_009051	C	7	7	1564061	1564067	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4126	NC_009051	TCT	2	6	1564124	1564129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_009051	CGTC	3	12	1564141	1564152	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4128	NC_009051	CCCG	2	8	1564157	1564164	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4129	NC_009051	CCT	2	6	1564173	1564178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4130	NC_009051	CTG	2	6	1564205	1564210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_009051	CAG	2	6	1564214	1564219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_009051	CTG	2	6	1564336	1564341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_009051	GAA	2	6	1564342	1564347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_009051	GGA	2	6	1564389	1564394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_009051	CCG	2	6	1564425	1564430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4155	NC_009051	CGG	2	6	1570131	1570136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4168	NC_009051	CCCGG	2	10	1578317	1578326	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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4267	NC_009051	TA	3	6	1642605	1642610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4268	NC_009051	CTA	2	6	1642642	1642647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4372	NC_009051	T	6	6	1666117	1666122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4373	NC_009051	TGG	2	6	1666138	1666143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4391	NC_009051	GA	3	6	1672243	1672248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4392	NC_009051	CAAC	2	8	1673015	1673022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4393	NC_009051	TTC	2	6	1673025	1673030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4395	NC_009051	CGTCC	2	10	1673096	1673105	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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